El edificio que alberga el Museo ha sido reconstruido en su totalidad para este fin. En origen fue Casa - Palacio de los Veráiz, familia de la nobleza tudelana que desde el Medioevo ocuparon diversos cargos en la Corte de Navarra y en la Merindad de Tudela. De su primitiva construcción gótica solamente se guarda una enjuta de la arquería del primer piso que contiene esculpido el escudo cuartelado de los Veráiz y que se conserva, testimonialmente, en la fachada. De esta primitiva época se conservan dos bodegas de sillería que se destinan como salas de talleres y cursos. El edificio fue remodelado profundamente durante el Barroco, como puede verse en el ritmo clasicista de los ventanales de fachada y en la sencilla decoración de placas pinjantes de los antepechos que sustentan los balcones. El Museo ocupa la planta baja del citado Palacio de Veráiz para servicios, y dos plantas en altura donde se distribuyen las salas de exposiciones de pintura del siglo XIX, además de las exposiciones temporales.